Laboratorio de Genómica
Investigadores
Laura Cristina Hernández
Investigador Asociado Claura.hernandez@cic.unam.mx
Técnicos académicos
Rosa Gloria Rebollar
Técnico Académico Asociado Crebollar@cic.unam.mx
Contacto
Para cualquier información relacionado con el servicio
o asesorías sobre las plataformas
Enviar correo a:
Teléfonos:
- +01 (55) 5487 0900
- Ext. 6328 ó 6329 (lab)
Servicios:
Secuenciación de RNA:
- - Secuenciación de ARNm
- - Secuenciación de ARN procariótico
- - Secuenciación de ARN pequeño
- - Secuenciación de ARN no codificante largo
- - Secuenciación de isoformas
- - Secuenciación de transcriptoma completo
- - Secuenciación de metatranscriptoma
- - Secuenciación de células individuales
Secuenciación de genoma completo:
- - Genoma humano
- - Genoma completo microbiano
- - Genoma completo de animales y plantas
Secuenciación de exoma:
- - Exoma de humano
- - Exoma de raton
Metagenómica:
- - 16S/18S/ITS
- - Shotgun
Epigenoma:
- - Secuenciación de genoma completo con bisulfito (WGBS)
- - Secuenciación de bisulfito de representación reducida (RRBS)
- - Secuenciación de inmunoprecipitación de cromatina (ChipSeq)
- - Secuenciación de inmunoprecipitación de RNA (RIPseq)
- - Secuenciación de accesibilidad a la cromatina (ATACseq)
- - Secuenciación de metilación enzimática (EMseq)
Entrega de los datos y análisis primario
El cliente puede traer su disco duro para descargar los datos directamente del equipo MiSeq o se pueden transferir mediante BaseSpace de Illumina para lo cual deberá crear una cuenta. En el caso de que el cliente desee el análisis primario deberá contactar a la Dra. Georgina Hernández Montes responsable del área de Bioinformática y con la Dra. María Cristina Carmona Isunza para los servicios de bioestadística.
Requisitos de las muestras
- Las muestras deberán diluirse en agua libre de nucleasas a una concentración de 100 ng/μl.
- Los usuarios deberán entregar al menos un volumen de 50 μl de DNA genómico o 100 μl de RNA total en un microtubo de 1.5 μl.
- Calidad mínima de las muestras: DNA razón 260:280>1.8; RNA RIN≥8.0.
Formatos
- Descargue el formato para la entrega y registro de las muestras:
- Formato para el registro de muestras
- Horarios de atención y servicio: lunes a viernes de 8 am a 4 pm.
Tarifas
El precio de los servicios dependerá del proyecto de investigación. Favor de solicitarlo con los responsables del Laboratorio de Genómica. Se recomienda hacer una cita para comentar los detalles del proyecto y el equipo más conveniente para el procesamiento de las muestras, así como el análisis bioinformático de los resultados.
| SERVICIO | CONSORCIO1 | INSTITUTOS NACIONALES DE SALUD2 | OTRAS DEPENDENCIAS PÚBLICAS | INSTITUCIONES PRIVADAS |
|---|---|---|---|---|
| Qubit 3.0 Fluorometer* | $40.00 | $44.00 | $48.00 | $52.00 |
| Estándares | $80.00 | $88.00 | $96.00 | $104.00 |
| Agilent 2100 Bioanalyzer** DNA 1000 kit | $1400.00 | $1540.00 | $1680.00 | $1820.00 |
| High Sensitivity DNA Kit | $950.00 | $1045.00 | $1140.00 | $1235.00 |
| RNA 6000 Nano Kit | $1250.00 | $1375.00 | $1500.00 | $1625.00 |
| Small RNA kit | $1800.00 | $1980.00 | $2160.00 | $2340.00 |
| Sonicador Covaris 2200*** | $100.00 | $110.00 | $120.00 | $130.00 |
| MiSeq Illumina®*** | $200-500 USD | $200-500 USD | $200-500 USD | $200-500 USD |
| MiSeq Illumina® Uso de equipo, corrida con operador ***** | $2500.00 | $3000.00 | $3500.00 | $4000.00 |
** 11-12 muestras/chip
*** Tarifa por hora de uso en equipo respectivo
**** Tarifa por muestra. El precio de los servicios dependerá de la muestra, cobertura y profundidad deseada. Favor de solicitarlo con los responsables del Laboratorio de Genómica. Se recomienda hacer una cita para comentar los detalles del proyecto y el equipo más conveniente para el procesamiento de las muestras, así como el análisis bioinformático de los resultados. Estos precios podrán ser modificados en función de las condiciones del mercado.
***** Tarifa por corrida de experimento.
1. Usuarios Consorcio RAI (INCMNSZ, INCAN, INCICH, INMEGEN, UNAM).
2. Usuarios afiliados a los Institutos Nacionales de Salud y Hospitales de Alta Especialidad de la CCINSHAE.
Dirección Postal
Red de Apoyo a la Investigación (RAI)
Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán Edificio de Radio-Oncología, 2o piso Vasco de Quiroga 15, Belisario Domínguez Sección XVI, Tlalpan C.P. 14080 Ciudad de México, CDMX MÉXICO
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