Laboratorio de Biología Molecular
Investigadores
Alfredo Ulloa
Investigador Titular Aaulloaa@unam.mx
Técnicos académcos
Rubén Gutiérrez
Técnico Académico Titular Argutierrezsagal@cic.unam.mx
Teresa Zariñán
Técnico Académico Titular Azarinan@cic.unam.mx
Servicios
- Secuenciación de ADN en electroforesis capilar
- Análisis de fragmentos
- Detección de micoplasma
Modalidades de la secuenciación
Se ofrece a los usuarios la secuenciación Sanger de ADN en dos modalidades:
- Electroforesis capilar de las reacciones de secuencia realizadas por eusuario.
- Reacción de secuencia, purificación y electroforesis capilar.
- ADN de aproximadamente 1 kb (amplicones): 100 ng/reacción
- ADN de aproximadamente 5 kb (plásmidos): 500 ng/reacción
- ADN de aproximadamente 20 kb (Cosmidos): 5000 ng/reacción
En esta modalidad, las muestras por analizar deben estar en tuboeppendorf de 1.5 ml completamente deshidratadas, etiquetadas con lainiciales del usuario seguido de numeración consecutiva.
En esta modalidad el usuario debe proveernos con el ADN que desesecuenciar y el oligonucleótido que se utilizará como primer o cebador.
El ADN debe tener una relación (Densidad Óptica a 260/280 nm) mayor igual a 1.8 y menor o igual a 2.
La integridad del ADN debe haber sido comprobada en electroforesis egel de agarosa.
El ADN debe haber sido resuspendido preferiblemente en H2O mQ estérilibre de endonucleasas.
La cantidad de ADN que el usuario debe de proveernos está en función dsu tamaño:
Preparación de la muestra
En un tubo eppendorf de 0.2 ml agregar el ADN, 4 µl de primer (0.8 pmoµl) y H2O suficiente para un volumen final de 15 µl.
La calidad del proceso de secuenciación depende principalmente de lcalidad y cantidad de ADN entregado.
Antes de enviar las muestras, se recomienda analizarlas por gel cuantificarlas por espectrofotometría. La cuantificación por gel esubjetiva y NO debe usarse para estimar la concentración de ADN.
La RAI puede adicionar los oligonucleótidos:
| 82- pUC/M13- FORWARD | 5> CGC CAG GGT TTT CCC AGT CAC GAC >3 |
| 113- pSG5-SV40PA | 5> GTC TAG AGT CGA CCA GAC ATG >3 |
| 130- pSG5 – β- globin | 5> CCT CTG CTA ACC ATG TTC ATG >3 |
| 170- pcDNA3.1-T7 PRIMER | 5> TAA TAC GAC TCA CTA TAG GG >3 |
| 203- pcDNA3.1-CMV PRIMER | 5> AGT TTG TTT TGG CAC CAA AAT CAA >3 |
| 289- pcDNA3.1-BGH | 5> CCT ACT CAG ACA ATG CGA TGC >3 |
La mecánica de trabajo será la siguiente:
- Las muestras a secuenciar junto con su respectiva solicitud serárecibidas en el área de recepción en el horario y fecha acordadpreviamente con el técnico encargado. El usuario debe anotarse en lbitacóra de recepción de muestras y entregar la imagen del gel.
- Los resultados se enviarán vía correo electrónico.
Cualquier duda, aclaración o sugerencia debe ser dirigida a la M. en C. Teresa de Jesús Zariñán García o al Dr. Rubén Gutiérrez Sagal.
Tarifas
| SERVICIO | CONSORCIO1 | INSTITUTOS NACIONALES DE SALUD2 | OTRAS DEPENDENCIAS PÚBLICAS | INSTITUCIONES PRIVADAS |
|---|---|---|---|---|
| StepOne Plus PCR en tiempo real (corrida) | $150.00 | $170.00 | $190.00 | $210.00 |
| Quant Studio 12KFlex (hora) | $250.00 | $280.00 | $300.00 | $350.00 |
| Detección de micoplasma en líneas celulares | $1000 | $1200 | $1500 | $1700 |
1. Usuarios Consorcio RAI (INCMNSZ, INCAN, INCICH, INMEGEN, UNAM).
2. Usuarios afiliados a los Institutos Nacionales de Salud y Hospitales de Alta Especialidad de la CCINSHAE.
| SERVICIO | CONSORCIO1 | INSTITUTOS NACIONALES DE SALUD2 | OTRAS DEPENDENCIAS PÚBLICAS | INSTITUCIONES PRIVADAS |
|---|---|---|---|---|
| Secuenciación de DNA (reacción y electroforesis) | $200.00 | $220.00 | $230.00 | $260.00 |
| Secuenciación de DNA (electroforesis) | $80.00 | $90.00 | $100.00 | $120.00 |
| Análisis de fragmentos | $90.00 | $105.00 | $115.00 | $145.00 |
1. Usuarios Consorcio RAI (INCMNSZ, INCAN, INCICH, INMEGEN, UNAM).
2. Usuarios afiliados a los Institutos Nacionales de Salud y Hospitales de Alta Especialidad de la CCINSHAE.
Dirección Postal
Red de Apoyo a la Investigación (RAI)
Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán Edificio de Radio-Oncología, 2o piso Vasco de Quiroga 15, Belisario Domínguez Sección XVI, Tlalpan C.P. 14080 Ciudad de México, CDMX MÉXICO
- Lun. - Vie. 8:00am - 4:00pm
- +01 (55) 5487 0900
- servicios_rai@cic.unam.mx
Enlaces
Atención a clientes
