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Servicios
- Secuenciación de genoma completo.
- Secuenciación de exoma.
- Secuenciación de novo de genomas de cualquier tamaño
- Identificación de variaciones en regiones blanco del genoma
- Diseño y análisis de páneles de variantes específicas
- Detección y validación de variaciones genómicas
- Secuenciación de metagenomas
- Análisis de variaciones en DNA mitocondrial
- Secuenciación del transcriptoma completo
- Identificación de sitios de splicing alternativo
- Identificación de RNA no codificantes con efecto regulador
- Análisis de expresión de genes blanco
- Descubrimiento de RNA pequeños
- Determinación de biomarcadores específicos
- Comprobación de perfiles de expresión en tumores
- Descubrimiento de regiones reguladoras
- ChIP-Seq
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Descripción
- Secuenciación de DNA
Durante la secuenciación de DNA, las bases nucleotídicas de un fragmento pequeño de DNA son secuencialmente identificadas a partir de las señales emitidas cuando el fragmento es re-sintetizado tomando una cadena de DNA como templado. La secuenciación de nueva generación (NGS) extiende este proceso a través de millones de reacciones paralelas de forma masiva. NGS involucra la secuenciación rápida de amplias regiones de DNA extendidas en el genoma. Los secuenciadores de Illumina son capaces de producir datos en el orden de gigabases en una sola corrida de secuenciación.
- Secuenciación de RNA
La secuenciación de RNA (RNA-seq) ha revolucionado la exploración y el estudio de la expresión génica en los últimos años. La RNA-seq permite la generación rápida de perfiles de expresión de transcriptoma para identificar y cuantificar transcritos tanto raros como comunes, alinear secuencias a través de sitios de splicing, y detección de isoformas, nuevos transcritos y genes de fusión.
- Preparación de bibliotecas para NGS
La preparación de bibliotecas de alta calidad para NGS es un elemento clave en los flujos de trabajo involucrados en el proceso de secuenciación. Las soluciones existentes en la preparación de bibliotecas para NGS son extensas e incluyen diversas aplicaciones, desde genoma completo hasta secuenciación de regiones de DNA blanco (incluyendo exoma y amplicones específicos), también como RNA blanco, transcriptoma, y secuenciación de RNA completo para una gran variedad de tipos de muestras.
Entrega de los datos y análisis primario
El cliente puede traer su disco duro para descargar los datos directamente del equipo MiSeq o se pueden transferir mediante BaseSpace de Illumina para lo cual deberá crear una cuenta. En el caso de que el cliente desee el análisis primario deberá contactar a la Dra. Nancy Mejía Domínguez responsable de la Unidad de Bioinformática.
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Requisitos de las muestras
- Las muestras deberán diluirse en agua libre de nucleasas a una concentración de 100 ng/μl.
- Los usuarios deberán entregar al menos un volumen de 50 μl de DNA genómico o 100 μl de RNA total en un microtubo de 1.5 μl.
- Calidad mínima de las muestras: DNA razón 260:280>1.8; RNA RIN≥8.0.
Formatos
Descargue el formato para la entrega y registro de las muestras:
Formato para el registro de muestrasHorarios de atención y servicio: lunes a viernes de 8 am a 4 pm.
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Tarifas
El precio de los servicios dependerá del proyecto de investigación. Favor de solicitarlo con los responsables del Laboratorio de Genómica. Se recomienda hacer una cita para comentar los detalles del proyecto y el equipo más conveniente para el procesamiento de las muestras, así como el análisis bioinformático de los resultados.
