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Última versión: 05-noviembre-2024
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Involucra la secuenciación masiva NGS de amplias regiones de ADN extendidas en el genoma. Los secuenciadores de Illumina premite producir datos en el orden de gigabases en una sola corrida de secuenciación.
La secuenciación de RNA (RNA-seq) ha revolucionado la exploración y el estudio de la expresión génica en los últimos años.
La RNA-seq permite la generación rápida de perfiles de expresión de transcriptoma para identificar y cuantificar transcritos tanto raros como comunes, alinear secuencias a través de sitios de splicing, y detección de isoformas, nuevos transcritos y genes de fusión.
La preparación de bibliotecas de alta calidad para NGS es un elemento clave en los flujos de trabajo involucrados en el proceso de secuenciación.
Las soluciones existentes en la preparación de bibliotecas para NGS son extensas e incluyen diversas aplicaciones, desde genoma completo hasta secuenciación de regiones de DNA blanco (incluyendo exoma y amplicones específicos), también como RNA blanco, transcriptoma, y secuenciación de RNA completo para una gran variedad de tipos de muestras.
Las muestras deberán diluirse en agua libre de nucleasas a una concentración de 100 ng/μl.
Los usuarios deberán entregar al menos un volumen de 50 μl de DNA genómico o 100 μl de RNA total en un microtubo de 1.5 μl.
Calidad mínima de las muestras: DNA razón 260:280>1.8; RNA RIN≥8.0.
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